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慢病毒生产PCR反应循环数解读

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ningxueqin 发表于 2024-05-14 21:26:28 | 显示全部楼层 |阅读模式
  在复性过程中引物与DNA模板链的结合是由碱基互补配对原理完成的。慢病毒生产CR需要模板和酶,每一次循环都需要。酶的数量是固定的,但模板在每一次的延伸就一次用完就没了。PCR反应参数包括变性温度和时间、复性温度和时间、延伸温度和时间、循环数四方面,在PCR反应过程中都发挥着至关重要作用。1 p8 h. a) G- F% x  H
  循环次数过多,并不会计产物也随之过度增加。因为再次循环都有高温到低的温度变化,聚合酶的活性有限,而且一般体系中引物和原料的量也不会是无限供应的。: r! T7 }' Y+ f0 g
  另外循环次数过多,产物间可能会形成较为复杂的结构,影响其作为模板的效率,因此循环次数不是越多越好,一般PCR反应的循环不超过35次。5 L- u2 i8 c  ^; w( X# M
  PCR循环数通常约为 30 个,循环次数过多,虽然可以在一定程度上增加产品的数量,但由于反应时间长,一些非特异性产品的扩增也会相应增加,并且随着酶扩增能力的降低,合成靶片段的能力也会降低,这也可能引起其他非特异性扩增。! [( v1 q2 Q5 ]
  DNTP也将被消耗,如果一个dNTP消耗很多,后续的扩增将不可避免地导致不匹配。因此,如果产品足够用于后续分析,循环时间将不会过度延长。在选定的变性温度下,DNA分子越长,完全分离两条链所需的时间就越长。如果变性温度太低或时间太短。
/ Y8 A4 q3 Z) e# r6 K* d" r  通常只有模板DNA中富含AT的区域被变性,在PCR的第一个周期中,有时变性时间通常设计为 5 min,以增加大分子模板DNA也称为预变性完全变性的可能性。当模板DNA的G + C含量超过 55% 时,需要更高的变性温度,源自古细菌的DNA聚合酶比TaqDNA聚合酶对高温的抵抗力更高。& N: u# K+ P, b5 k. J) q
  因此,它更适合扩增富含GC的DNA模板,复性过程中使用的温度比如:I.E.退火 是至关重要的,如果复性温度过高,寡核苷酸引物不能用模板很好地复性,扩增效率将非常低。从这个角度来看,绝大多数扩增产品应该是特异性扩增产品,而非特异性扩增产品太低而无法检测。6 I1 y, H( j. N" o* r5 N  P

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