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生产抗体的公司实验室荧光定量PCR仪选择误区

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ningxueqin 发表于 2023-11-10 00:14:28 | 显示全部楼层 |阅读模式
  生产抗体的公司光定量PCR 因操作方便、运行速度快、实验结果准确,受到越来越多的分子生物学研究者青睐。在实验技术成熟的今天,也许对你来说,最难得不是实验技术上的问题——而是选择哪一种荧光定量PCR仪——你要征询实验室成员的意见、分析实验室目前乃至将来的需求、平衡实验室的预算,更要详细研究各种极富you惑力的宣传资料。面对各种不同性能的产品,您又该如何选择呢?
* ]& }" G0 o: @6 q  先建议大家走出认识荧光定量PCR的两个误区:2 l; b6 _9 N. Q+ L
  误区一:仪器通道越多越好
- z+ E5 ]4 v- n  随着PCR技术的成熟运用,多重扩增越来越热闹,荧光定量PCR仪也不能幸免。从蕞初ABI公司推出的单通道荧光定量PCR仪发展到如今各个都推出4通道、5通道甚至6通道荧光定量PCR仪,眼花缭乱的选择让人无所适从,就有人一不小心走进了“通道越多越好"的误区。
; E* l1 v5 L# M: h' y! \' L  Q( Q  在使用有些5通道的荧光定量仪时,为了确保实验结果的精确性和准确性都要在实验中使用ROX(一种荧光染料)或专用的Reference dye ,这些荧光染料都必须单独使用一个检测通道。这样以来,真正能检测多重PCR荧光信号的有效通道只有4个,而且使用校正染料可能会增加后期的使用成本。有的荧光定量PCR的检测通道是只为自已的专用的荧光染料或试剂开放的,有效检测通道也绝非像宣传资料中宣称的那么多。在购买前确认荧光定量PCR仪器的有效检测通道尤为重要,不能单单只听宣传。
# ^+ k9 V0 g8 Y" w, J" [  考虑多重荧光定量PCR的通道数的时候也应该从实验室实际情况出发,多重PCR并非人人适用、人人可用,因为它使实验复杂化了。5 C- X! L) j. k! K0 \/ f
  误区二:real-time PCR仪无需梯度功能% E0 s! t  u' b/ N2 N
  对于使用染料法的定量PCR反应,虽然有各种各样的PCR引物设计软件或者经验公式计算熔解温度(Tm值),但运用的公式不同、引物序列不同,Tm值的差异会很大。引物的熔解温度决定了退火温度。而且模版中碱基的组合千变万化,对于特殊片断,经验公式得到的数据不一定能得出准确的结果,退火温度细微的差异对结果都可能产生决定性的影响,因而“摸条件"一度是让人很头疼的问题。梯度PCR的出现部分解决了一些问题——在反应过程中每个孔的温度控制条件可以在zhi定范围内按照梯度变化,根据结果,一步就可以摸索出z适合的反应条件。; j* F7 X7 [4 @% z
  不单退火温度,连变性温度和延伸温度都可以优化——对于多种聚合酶混合酶扩增如Invitrogen、Clontech、Promega的多数高保真Taq酶来说这个非常重要,因为Taq和校正酶的蕞佳反应温度可能有显着差异,优化延伸温度就显得很重要。6 R+ q; c# e2 ~2 \) r% F
  使用有梯度功能的荧光定量PCR可以一次完成以往多次实验才能完成的优化过程,简化了摸索 PCR反应条件的繁琐实验,既节省实验时间提高效率,又节省实验成本。  I7 f+ U5 h) ^
  当我们走出误区,想要选择一款z适合自己需求的荧光定量PCR仪时我们又该关注些什么呢?
' J8 y2 R  B/ t0 ?  ?5 E( ]  1、 仪器的检测通量
, {0 d* B7 L+ V  在购买定量PCR仪的时候要根据实验实的需要来选择不同通量的仪器。目前市面上的荧光定量PCR的检测通量小到16个多到384个。如果进行一般的基因表达研究或病原体检测,实在不必购买昂贵的仪器,96孔的通量足够用;需要寻找要新药靶点和疾病标记的实验室可以考虑购买384孔板的仪器。假如经费有限无法购买384孔板仪器的实验室,可以考虑购买运行速度快(带有FAST模块)的96孔板荧光定量PCR仪。有了高通量的仪器,你会发现样品的制备和小体系、多样本的PCR体系构建成为限制实验速度和结果的颈瓶。
1 P, c9 C7 r* j3 u6 g. F4 p  2、 硬件设计特点( P/ ]0 N1 V9 l- h% [8 _' P
  荧光定量PCR仪主要有传统的96孔板式、创新的离心式等,每种设计都有它的独到之处但也都有无法避免的缺憾。
  `! l" u, P* g5 n, {; |  传统的96孔板的荧光定量PCR可以容纳的样本量大,而且无需特殊的耗材。有些传统的96孔板的仪器采用卤钨灯激发、CCD检测,这些光学结构在96孔板的顶部,每个样品孔距光源和检测器的光程各不相同——边缘效应,对结果产生影响。为了保证精确、准确的实验结果,这类仪器在实验过程中通常会使用ROX(一种荧光染料)或专用的Reference dye作为参照校正实验结果。卤钨灯的使用寿命短、更换成本较高已经成为很多用户头痛的问题。在实验过程中卤钨灯作为一种热光源,产生较多热能对实验结果有一定的影响。CCD蕞大的优点就是可以同时扫描所有样品中的荧光信号,但是灵敏度较低,而且同时检测样品间的荧光信号存在干扰。4 b" R6 P1 w  z/ C8 R4 v' e" t6 m
  3、 运行速度
( i9 ]3 |! f  ~3 w  在荧光定量PCR仪的众多技术参数中,升降温速度也是喜欢大力宣传的指标。更快的升降温,可以缩短反应进行的时间,而且缩短了可能的非特异性结合、反应的时间,提高PCR的特异性。: l$ u) n& ]' G6 h- M
  4、 灵活性1 A% `1 B4 y4 U# O9 ]
  大规模繁忙的实验室设备固然让人羡慕,但是常规实验室同样可以有精彩的选择。现在的仪器供应商拥有众多技术专家,有的还能提供整个分子生物学的基础研究平台,不但了解、满足您现在的需求,而且还考虑到了你可能变化的需求——升级和更换模块。! X  r( {- g$ f

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