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三九蛋白肽提高抗辐射能力的作用机理是： （1）营养、增殖细胞，修复受损细胞。当辐射进入人体后，人体正常细胞的数量也会减少。小肽进入人体后直接与人的细胞融合，并提供营养，加快正常细胞的生长，填补因辐射造成的细胞的减少，特别是改变白血球减少的状况。同时，小肽可通过自身的活性和营养修复受损细胞，并激活受损细胞，使受损细胞恢复正常。 （2）防止和纠正人体DNA转入错位。当辐射损伤人体后，人体的DNA转录系统会受到损害，一旦DNA转录紊乱出现，DNA转录就会错位，因DNA转录的错位，肿瘤就会出现。三九蛋白肽中的小肽进入人体后，可以纠正DNA转录的紊乱状况，使DNA转录错位的现象得以防止和纠正，避免肿瘤的出现。 （3）修复免疫系统、增强免疫功能。当辐射伤害人体后，免疫系统会受到严重破坏，人体抵抗力大大减弱，各种病毒细胞就会乘虚而入。当小肽进入人体后，可通过自身营养、活性，刺激巨噬细胞吞噬肿瘤细胞的能力，使因辐射造成的脆弱的免疫系统，得以增强和恢复。
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