过表达细胞系构建PCR检测试剂盒操作步骤
过表达细胞系构建PCR 由变性——退火——延伸三个基本反应步骤构成。准备好各种试剂和 PCR 仪,就可以开始 PCR 实验:将各种试剂混合并按照说明书设置 PCR 反应。一般 PCR 循环如下:
1、起始步骤:这对于热启动 PCR 而言是必须的,将反应混合液加热至 94——98 ℃ 以激活 DNA 聚合酶。这一步的时间取决于所选用的 DNA 聚合酶。
2、 变性步骤:DNA 本身是双链结构,而 DNA 扩增需要引物与单链 DNA 模板相结合。在这一步,反应混合液被加热至 94——98 ℃ 保持 20——30 秒以破坏双链间的氢键以便释放出单链 DNA。这是 PCR 循环中的第一步。
3、退火步骤:变性之后,DNA 模板以单链的形式在反应混合液中存在。因为反应体系中的引物与 DNA 模板互补,当反应温度降至 50——65 ℃ 时,引物与互补的序列形成氢键。退火温度主要取决于引物的 Tm 值,通常比引物 Tm 值低 3——5 ℃。这一步通常维持 20——40 秒,而聚合酶会结合至引物-模板双链处开始 DNA 合成。
4、延伸步骤:在这一步,DNA 聚合酶开始 DNA 合成,因此这一步的温度选取的是 DNA 聚合酶的最优温度。通常我们选用 72 ℃,但某些 DNA 聚合酶的最适温度是 68 ℃。这一步与体内的 DNA 复制很相似:DNA 聚合酶按照碱基互补规律将 dNTPs 加到引物的 3’ 末端最终得到新的 DNA 双链片段。延伸时间取决于目的 DNA 片段的长度和 DNA 聚合酶的合成能力。一般而言 DNA 聚合酶每 60 秒能够合成 1 kb 长度的 DNA。
5、 循环:第 2 步至第 4 步称为一个循环。每次循环之后 DNA 的量均是前一次的两倍。通常一次 PCR 反应进行 30——35 个循环。在前几轮的 PCR 循环过程中 PCR 产物的量以指数速率增长,但是到了反应后期随着 dNTPs 和引物的量的减少以及 DNA 聚合酶的失活,反应速率逐渐下降,因此 PCR 反应的产量也受到了限制。
6、 最后的延伸步骤:当 30——35 个循环结束后,我们通常会以 68——74 ℃ 延伸 5——10 分钟,这是希望使反应体系中残留的单链 DNA 全部反应完毕。
保存温度:通常我们设置 4——10 ℃ 为反应后 PCR 产物的保存温度。
每完成一个循环需 2——4 分钟,2——3 小时就能将待扩目的基因扩增放大几百万倍。到达平台期 (Plateau) 所需循环次数取决于样品中模板的拷贝。PCR 的反应动力学 PCR 的三个反应步骤反复进行,使 DNA 扩增量呈指数上升。
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